Varningen utfärdas sedan det kommit medieuppgifter om att Apple planerar att köpa in chip från kinesiska Yangtze Memory Technologies (YMTC) för att använda dem i flashminnet i den senaste Iphone-mobilen, lanserad i veckan.
– De känner till säkerhetsriskerna som YMTC utgör. Om de går vidare med detta kommer de att bli föremål för en tillsyn som aldrig förr av federala myndigheter, säger Marco Rubio.
– Vi kan inte tillåta att kinesiska företag som kontrolleras av kommunistpartiet tar sig in i våra telekomnät och miljontals amerikanska mobiltelefoner, tillägger han.
Demokratiska partiets majoritetsledare i senaten, Chuck Schumer, har också tagit upp frågan med USA:s handelsminister Gina Raimondo, rapporterar tidningen med hänvisning till en källa.
Enligt Apple överväger man att använda teknik från YMTC i mobiltelefoner som säljs i Kina och all data som lagras i mobilen kommer dessutom att vara fullt ut krypterad.