Problemet omfattade alla Swish-kunder.
– Det är inte hos oss själva störningen ligger men det drabbar Swish-kunderna ändå, säger Matilda Westerman, från Swish presstjänst.
Störningen, som varade klockan 05.30-08.50 på måndagen, är nu löst, meddelar Bankgirots presstjänst.
"Vi har full förståelse för att detta påverkat många som velat betala med Swish och beklagar de problem som uppstått", skriver Sara Bringzén, kommunikatör på Bankgirot, i en kommentar till TT.