Under en intervju med veckomagasinet L'Obs på onsdagen sade Beaune att billiga flygbiljetter inte är rimliga.
– Flygbiljetter för tio euro när vi befinner oss mitt i en ekologisk omställning – det är inte längre möjligt. Det avspeglar inte priset för planeten, sade Clément Beaune.
Flygresor har högre utsläpp av växthusgaser än tågresor och Beaune uppmanade i intervjun till beskattning av aktiviteter som genererar utsläpp. Han tillade att Frankrike planerar att höja skatten på avgående flyg från landet för att finansiera järnvägsinvesteringar.