Anledningen är att ägandeformen där näringslivet äger ena halvan och staten den andra kan ge begränsad insyn och minskad konkurrensneutralitet, menar Riksrevisionen.
"Business Sweden är varken myndighet eller bolag, där ingen av ägarna har ett dominerande inflytande. Det har lett till en komplex styrning med stora utmaningar", säger riksrevisionsdirektör Claudia Gardberg Morner i ett pressmeddelande.
Business Sweden, som hjälper svenska företag att expandera utomlands och internationella bolag att göra samma sak i Sverige, har en styrelse där staten och näringslivet tillsätter hälften av ledamöterna vardera.
Riksrevisionen ska nu ta reda på om styrningen är "effektiv för att uppnå statens mål med verksamheten."