Orsaken som anges är betydande förseningar och oförmågan hos Rosatoms finländska dotterbolag Raos Project att genomföra projektet. Dessutom har ryssarnas anfallskrig mot Ukraina ytterligare ökat riskerna, enligt Fennovoima.
"Uppsägningen av avtalet får tyvärr betydande följder för Fennovoimas anställda. Dessutom väntas följderna också drabba alla aktörer i leverantörskedjan och Pyhäjokiområdet", skriver Fennovoimas vd Joachim Specht i ett pressmeddelande.
Han skriver också att man blir tvungen att minska personalstyrkan väsentligt fram till årsskiftet.
Uppsägningen innebär att samarbetet avslutas med omedelbar verkan.
Det var redan i februari som Finlands statsminister Sanna Marin meddelade att Finland skulle se över säkerhetsriskerna med att låta Rosatom bygga kärnkraftverket i landet.
Finlands närings- och energiminister Mika Lintilä skriver på Twitter att Fennovoimas beslut är tydligt.
"Vi ska vara nöjda med ägarnas beslut. Det hade varit praktiskt omöjligt att gå vidare med projektet. På departementet utvärderar vi vad beslutet har för följder ur myndighetens synvinkel", skriver han.
Reaktorn skulle enligt plan tas i bruk 2029 men bygget låg redan drygt tio år efter sin ursprungliga tidtabell.