Det var en något kraftigare prisökning än i augusti, då priserna steg med 0,5 procent. Men det låg i linje med förväntningarna.
Inflationen, det vill säga prisökningarna i årstakt, lyfte till 3,2 procent i september enligt beräkningarna, upp från 2,4 procent i augusti. Ökningen var dock något mindre än befarat. Analytiker hade i snitt räknat med en septemberinflation i Spanien på 3,3 procent enligt det EU-harominserade måttet.
Statistiken presenteras inför fredagens preliminära inflationssiffror för september för hela eurozonen.