Utredare från finansmyndigheten Bafin misstänker att banken genomfört transaktioner som kan kopplas till pengatvätt.
Enligt tidningen Handelsblatt rör det sig om transaktioner där Syriens ledare Bashar al-Assads farbror Rifaat al-Assad varit inblandad.
Rifaat al-Assad dömdes 2020 i en fransk domstol till fyra års fängelse för att bland annat ha tvättat pengar för att skapa en fransk fastighetsportfölj. Han ledde Syriens ökända säkerhetsstyrkor på 1970- och 1980-talen.
I fjol uppmanade Bafin Deutsche Banks ledning att öka sina insatser för att förhindra pengatvätt. Banken uppger i ett uttalande att de samarbetar med Bafin i utredningen.