Nikkei 225-indexet gick ned 0,3 procent medan det bredare Topixindexet sjönk 0,6 procent.
En avvaktande inställning var att vänta då skärtorsdagens handel på Wall Street avslutades med minusresultat och börserna är helgstängda under fredagen.
Även börserna i Fastlandskina tappade. Kompositindexet i Shanghai föll 0,1 procent medan det i Shenzhen gick ned 0,9 procent.
Seoulbörsens Kospi-index backade 0,7 procent. Börsen i Hongkong var stängd på fredagen.