Det breda OMXS-indexet avslutade på minus 0,4 procent.
Samtidigt som börsen i Stockholm sjönk vände de ledande europeiska börserna till plus under handelsdagen. FTSE 100 i London ökade 0,4 procent, DAX-index i Frankfurt 0,2 procent och CAC40-index i Paris 0,3 procent.
På Stockholmsbörsens OMXS30-index över de mest omsatta aktierna föll SBB mest av alla bolag, med 4,9 procent.
Medicinteknikbolaget Getinge steg i stället med 3,5 procent.
Trots helgens bankdramatik i Schweiz har bankaktier i Europa, inklusive de svenska storbankerna, stigit på börserna de senaste dagarna.
Nordea gick plus 0,3 procent, SEB 0,4 procent och Handelsbanken 0,2 procent. Swedbank bröt banktrenden och landade på minus 0,5.
Onsdagens handel skedde inför den amerikanska centralbanken Federal Reserves räntebesked under kvällen.