"Många har fått vänta oacceptabelt länge på att få sin a-kassa", skriver regeringen i ett pressmeddelande.
IAF ska också granska hur a-kassornas tillfälliga bidrag om 100 miljoner kronor för att motverka långa handläggningstider har använts.
Förslaget om en analys av a-kassorna bygger på en överenskommelse mellan regeringspartierna och Centerpartiet och Liberalerna. Uppdraget ska rapporteras senast den 1 december nästa år.