"Arbetsbelastningen för e-handelns medarbetare är mycket hög och arbetsgivarna måste ta den på stort allvar", skriver myndigheten.
Hittills har Arbetsmiljöverket inspekterat 681 arbetsplatser i sektorn.
Bland annat konstaterar myndigheten att en hög andel av pakethanteringen sker manuellt, med få lyfthjälpmedel på plats.
"29 procent av bristerna handlar om medarbetarnas belastningsergonomi", skriver verket.