Köpeskillingen uppgår till 1,8 miljarder kronor.
I samband med transaktionen planerar Axfood att göra en nyemission på 1,5 miljarder kronor, skriver bolaget.
Vid sidan av förvärvet av Bergendahlsaffären förvärvar Axfood en minoritetsandel på 9,9 procent av aktierna i City Gross Sverige AB.
"Det finns en tydlig industriell logik i den här affären, som skapar förutsättningar för att stärka både våra och Bergendahls partihandelskunders konkurrenskraft. På butikssidan är jag imponerad över City Gross utveckling den senaste tiden, och övertygad om att vi genom vårt partnerskap ytterligare kan stärka City Gross position inom stormarknadssegmentet, där Axfood i dag inte är verksamma", skriver Klas Balkow, vd och koncernchef för Axfood, i en kommentar.