Uppgörelsen, som motsvarar över 100 miljarder kronor, kommer efter över ett års förhandlingar och gäller enligt företaget runt tre fjärdedelar av de 125 000 skadeståndsanmälningar som har kommit in.
– Det här är rätt väg att gå vid rätt tillfälle och avslutar en lång tids osäkerhet för Bayer, säger styrelseordföranden Werner Baumann i ett uttalande, och lägger till:
– Tyvärr tvingas vi betala ut en hiskeligt stor summa för en produkt som är hårt reglerad.
Bayer hävdar fortsatt att Roundup är säkert och företaget kommer att fortsätta sälja medlet utan varningar för att det kan orsaka cancer. I uppgörelsen ingår att företaget inte medger att något fel har begåtts eller att de tar ytterligare ansvar i frågan. Bayer ärvde Roundup-stämningarna när bolaget 2016 köpte det amerikanska företaget Monsanto.
Tre fall, som redan har tagits upp i domstolar, ingår inte i uppgörelsen och rättsprocesserna för dem kommer att fortsätta.