Enligt applikationens hemsida rörde det sig om en driftstörning som inträffade från klockan 12.41 och som var avhjälpt 14.15.
Anledningen till lördagens driftstörning var oklar, och representanter för betalappen kunde inte nås.
Swish drabbades av driftstopp även på fredagsmorgonen, ett problem som då kunde lösas efter drygt en timme. Fredagens problem var inte kopplat till något planerat driftstopp, sade Sofia Norén, talesperson för Swish.
Hon sade då att det inte rörde sig om någon belastningsattack.