Tokyobörsens Nikkei 225-index sjönk 0,8 procent, medan det bredare Topix-index gick ned 1,2 procent.
Taiwanbörsen backade 0,9 procent.
Shanghaibörsen hade i den avslutande handeln gått upp 0,2 procent, medan Hongkongbörsen hade tappat 1 procent.
Seoulbörsen hade det tyngre, med ett fall för Kospi-index på 1,8 procent inför stängning.
Oljepriset faller också hårt i den våg av oro för en andra våg av coronasmitta i USA som spridit sig på marknaden sedan antalet nya covid-19-fall ökar i ett stort antal delstater i USA igen – bland annat i New Mexico, Utah, Arizona, Florida och Arkansas.
Dollarn stärktes samtidigt mot både den japanska yenen och Kinas yuan, vilket är vanligt när många investerare samtidigt söker säkra placeringar i orostider.