Ilya Yepifanau, ansvarig läkare på spaanläggningen, säger att Swedbank har fryst kontona till följd av EU:s sanktioner mot Belarus.
Utrikesminister Gabrielius Landsbergis talesperson säger att spaanläggningen berörs eftersom den ägs av ett bolag som är nära knutet till president Aleksandr Lukasjenko.
En talesperson för Swedbank bekräftar att banken har informerat sin klient om situationen, men vill inte kommentera ytterligare.
EU har infört sanktioner mot Belarus som svar på regimens hantering av protesterna mot resultatet i presidentvalet i augusti. Unionen har uttalat att Lukasjenko inte längre betraktas som landets rättmätige president.