En dollar kostade på måndagsmorgonen cirka 8,5 lira, jämfört med 7,22 i slutet av förra veckan, innan den återhämtade sig något, och placerade sig kring 8,1.
Det gavs ingen förklaring till varför Naci Agbal fick lämna posten, men beskedet kom sedan centralbanken i torsdags höjde räntorna med mer än de väntade 200 räntepunkterna till 19 procent.
President Recep Tayyip Erdogan har utsett Sahap Kavcioglu, en före detta parlamentsledamot för Erdogans regerande AK-parti, till Agbals ersättare.