Nikkei 225-index sjönk 1,4 procent och det bredare Topix-index backade 0,7 procent på veckans sista handelsdag.
Börserna i Kina stiger däremot efter gårdagens besked från den amerikanska centralbanken Federal Reserve som öppnat för att låta inflationen stiga över målet på 2 procent. Positiva signaler om återhämtning i Kinas ekonomi bidrar också till att lyfta humöret.
Hongkongs Hang Seng-index stiger 1,1 procent medan Shanghais kompositindex ökar 0,8 procent.
Taiwans Weighted index backade 0,5 procent.
Seoulbörsens Kospi-index stiger 0,5 procent.