Störande byggprojekt, med höga ljud och kraftiga vibrationer, har stressat fisken, skriver det nyligen börsnoterade bolaget i ett pressmeddelande.
Laxaktien rasar med nästan 9 procent efter beskedet.
– De förlorar omkring 550 ton lax. Det betyder inte så mycket, men det skapar osäkerhet kring hur det ska gå med ett bolag som i praktiken ska bygga ut i tio år till, säger Christian Nordby, analytiker på mäklarhuset Kepler Cheuvreux till den norska affärstidningen Dagens Næringsliv.
Atlantic Sapphire varnar samtidigt för ökade risker för verksamheten i närtid till följd av pandemin.
"Bolaget utvärderar fortfarande den fullständiga finansiella effekten från händelsen, inklusive försäkringsutbetalningar", skriver bolaget och bekräftar samtidigt att produktionen i USA ser ut att kunna inledas som planerat mot slutet av tredje kvartalet i år.
Atantic Sapphire, noterat på Olsobörsen sedan maj i år, odlar även fisk i Danmark.