Det var efter att flisbilens förare hade lastat bil och släp vid Vallnäs såg som olyckan inträffade.
Järnvägsövergången har ljus och ljudsignaler men hur olyckan gått till är oklart.
Rälsbussen kom från Eksjöhållet och var på väg till Hultsfred.
Rälsbussens framparti träffade bakre delen av släpet och en av containrarna kastades av släpvagnen.
Rälsbussen blev intryckt i fronten och spårade även ur.