Våldtäkten ska ha begåtts mellan den 28 och 29 oktober på en adress i centrala Hultsfred.
Mannen, som är bosatt i Hultsfred, anhölls i sin frånvaro den 31 oktober. Anhållningsbeslutet kunde verkställas dagen därpå.
Åklagaren menar att det finns risk för att mannen undanröjer bevis eller försvårar utredningen på annat sätt.