Mannen som är i 60-årsåldern sågs på fredagseftermiddagen i centrala Uppsala och polis larmades.
– Han ska ha misshandlats med någon form av tillhygge, säger Tobias Ahlén, presstalesperson på polisen, som inte har några uppgifter om hur länge mannen hållits instängd.
Mannen är förd till sjukhus.
– Jag har inga uppgifter om att det ska vara livshotande skador.
Strax efter att mannen hittades gjorde polisen en husrannsakan i lägenheten.
– Vi påträffade en kvinna som grips och kort därefter greps två män i närområdet. De är i spannet 40 till 60 år, säger Tobias Ahlén.
Personerna förhörs under kvällen och en förundersökning gällande grov misshandel och människorov är inledd.