Enligt myndigheten riskerar vissa personer som återvänder till landet att kallas till statlig militärtjänstgöring och därmed medverka till att brott begås.
"Alla värnpliktiga riskerar numera att tvingas utföra eller medverka till att utföra krigsförbrytelser. Att riskera att behöva utföra eller medverka till krigsförbrytelser är grund för att beviljas skydd i Sverige", säger Carl Bexelius, biträdande rättschef på myndigheten, i ett pressmeddelande.
Dessa personer riskerar att bli utsatta för förföljelse och enligt Migrationsverket bör de beviljas flyktingstatus i Sverige.
Vid eventuella undantag ska en bedömning av individens skyddsbehov göras.