Ytterligare sex personer uppger vara saknade, sedan angriparna slog till mot byarna.
– De kom på mer än 50 motorcyklar. För närvarande har vi hittat tolv kroppar, säger en släkting till en av de dödade.
Dödstalet i byarna nära staden Bandiagara i regionen Mopti bekräftas av FN-anställda i området.
– Det som dödar oss är inte coronavirus utan krig, säger Ali Dolo, borgmästare i området där attackerna skedde.
Han säger att gärningsmännen försvann med cirka 500 nötkreatur, får och getter.
Enligt flera källor tillhörde förövarna herdefolket fulani.
Det utbredda våldet i Mali har islamistiska, kriminella och etniska motiv.