Det misstänkta brottet skedde i samband med en aktivitet i en klubblokal i december.
Flickan är yngre än 18 år. Enligt åtalet var hon så berusad att hon var i en särskilt utsatt situation.
– Det har tränaren utnyttjat, säger kammaråklagare Andréas Pernmyr till TT.
Flera personer som befann sig i klubblokalen har vittnat i utredningen.
Mannen är i 40-årsåldern. Han nekar till brottet och har gjort en motanmälan om förtal, skriver Göteborgs-Posten.