Åtalet gäller fem våldtäkter, varav tre grova, mot en flicka, och en grov våldtäkt mot den andra flickan.
Vid de grova våldtäkterna har 25-åringen, enligt åklagaren, hotat flickorna för att få dem att delta i samlag som filmades. Hoten framfördes i meddelanden där mannen utgav sig för att vara en annan person. Flickorna fick intrycket att personen hotade både dem själva och 25-åringen.
Den åtalade nekar till brotten. Han greps i augusti, sedan en anhörig till en av flickorna slagit larm.
Mannen fick inledningsvis kontakt med en av flickorna via nätet. De misstänkta brotten begicks med början i maj. En av våldtäkterna uppges ha skett på ett hotell.
En viktig del i utredningen har varit att man kunnat göra husrannsakan på distans i så kallade molntjänster, enligt en ny möjlighet som polisen fått i sitt regelverk.
– Det har varit avgörande, skulle jag säga, för att vi har ett såpass starkt bevisläge, säger kammaråklagare Andrea Andersson.
Det är främst konversationer i chattforum som polisen kunnat säkra på det sättet.
– Man har kommit åt dem via en telefon som tagits i beslag, säger Andersson.
Tidigare har utredarna, i ett sådant läge, bara kunnat komma åt material som funnits lagrat i telefonen.