Den misstänkta förskingringen, som tros ha pågått under flera år, avslöjades i förra veckan då det upptäcktes att små utbetalningar från kommunerna gått till chefens konto.
Chefen avskedades tidigare i veckan och en polisanmälan om grovt bedrägeri har gjorts.
Kommundirektören i kommunen där chefen hade sin huvudsakliga anställning säger till SVT Skåne att personen "har missbrukat vårt förtroende och varit extremt illojal".