Mannen, som är anställd på macken, vårdas på sjukhus.
Enligt Region Kalmar är mannen allvarligt skadad.
– Gärningsmannen, maskerad, lång, smal och med svarta kläder, fick inte med sig något gods. Det är oklart hur han lämnade, om det var till fots eller på cykel eller på annat sätt, säger polisens presstalesperson Evelina Olsson.
Larmet inkom klockan 21.36.
– Vi går igenom mackens övervakningsfilmer bland annat, säger Olsson.
Polisen har spärrat av bensinmacken.