Paret, som båda är anhållna, greps i gryningen i Stockholmsområdet i samband med en insats av Säkerhetspolisen.
Mannen har haft flera nyckelpositioner inom Försvarsmakten både i Sverige och utomlands, skriver Expressen. Periodvis har han arbetat med koppling till den militära underrättelsetjänsten Must. I dag arbetar han i en annan myndighet.
Även kvinnan har en känslig befattning vid en myndighet, enligt en källa till Expressen.
Kammaråklagare Mats Ljungqvist vill inte kommentera ärendet för tidningen.
– Det är locket på. Vi bekräftar ingenting. Ärendet är känsligt, säger han.
Säpo har gjort en stor mängd beslag i parets bostad och på ytterligare minst en adress, skriver Expressen. Bland annat handlar det om mobiler och datorer. Husrannsakan har också gjorts på de misstänktas arbetsplatser.
– Jag kan inte ge några kommentarer i ärendet. Det råder yppandeförbud, säger advokat Thomas Olsson, som företräder en av personerna, till tidningen.
Brottet obehörig befattning med hemlig uppgift klassas som ett brott mot rikets säkerhet.