Insatsstyrkan sköt verkanseld när mannen inte lydde en order om att lägga ifrån sig sitt vapen, uppger polisen. Mannen fördes sedan till sjukhus med ambulans.
Skottlossningen ska utredas av en särskild åklagare.
– Det är flera förhör som behöver hållas, säger Anna Göransson, presstalesperson på polisregion Väst.
Polisen åkte till platsen vid sextiden på onsdag morgon, efter ett larm om att fönsterrutor krossats. När man kom dit, sågs en person med ett vapenliknande föremål inne in i bostad.
Insatsstyrkan tillkallades, tog sig in i bostaden och träffade på mannen.
– Ingen mer person var där, säger Göransson.
Den skjutne mannen är gripen som misstänkt för grovt vapenbrott.