Hittills har över 800 fall av covid-19 bekräftats i Kanada, i USA är antalet över 11 500.
– Det här är svåra och extraordinära tider då kanadensare tar till svåra och extraordinära åtgärder, säger Trudeau till journalister utanför sitt hem, där han för tillfället håller sig isolerad då hans fru Sophie Grégoire Trudeau har testats positivt för coronaviruset.
Enligt amerikanska källor till Reuters väntas även liknande gränsbestämmelser införas vid USA:s gräns mot Mexiko.
Under 2019 korsade cirka tre miljoner personbilar varje månad gränsen vid San Diego i USA och Tijuana i Mexiko på laglig väg.