Den tolv ton tunga bogrampen bärgades strax efter 02 natten mot tisdagen.
Arbetet försenades eftersom utsidan av rampen behövde grävas fram för att inte gå sönder. Den kommer nu att tas till Estland för undersökning.
Statens haverikommission och motsvarande myndigheter från Estland och Finland undersöker för tredje sommaren i rad Estonias vrak.