"Hbtqi"-personer ska få ett särskilt fokus eftersom gruppen "riskerar en högre grad av utsatthet och ohälsa än andra unga".
Arbetet ska resultera i exempel på faktorer som stärker ungdomars psykiska hälsa och på vad unga själv vill ha för stöd.
Uppdraget kommer från regeringen och ska delredovisas i sommar. Förutom Folkhälsomyndigheten deltar även myndigheten för ungdoms- och civilsamhällesfrågor (MUCF).