Naturvårdsverket i samråd med Folkhälsomyndigheten får nu i uppdrag att utreda förutsättningarna för hur spårningen kan gå till.
"Det är viktigt nu under coronapandemin, men också då vi vet att vi riskerar fler pandemier längre fram att vi står förberedda och har flera sätt att spåra smittan på", säger miljö- och klimatminister Per Bolund i ett pressmeddelande.
Bland andra Sahlgrenska universitetssjukhuset i Göteborg och KTH i Stockholm har under pandemin konstaterat hur virusnivåerna i avloppsvatten periodvis skjutit i höjden.
EU-kommissionen har rekommenderat en gemensam ansats för att systematiskt övervaka covid-19.