Pengarna är en del i en kampanj och kommer från ett pris hon vann av den danska organisationen Human Act, som har lovat att donera lika mycket.
"Precis som klimatkrisen är coronapandemin en barnrättslig kris. Den kommer att påverka alla barn nu och på sikt, men sårbara grupper kommer att påverkas mest", säger Greta Thunberg i ett uttalande.
Hon uppmanar därför sina följare att stötta Unicefs arbete för att skydda barns liv och se till att deras skolgång fortsätter.
Konkret kommer stödet, som motsvarar 986 000 svenska kronor, att gå till distribution av tvål, skyddsutrustning, sjukvårdsartiklar samt olika informationskampanjer och utbildningsinsatser.
1,5 miljarder barn kan inte gå till skolan på grund av att deras skolor är stängda världen över och miljontals barn riskerar att hamna i extrem fattigdom som en följd av pandemin, enligt Unicef.