"Må mitt land, som jag aldrig ville skada, och vår president, som jag kommer att vara trogen hela livet, förlåta mig", skriver Soylu i ett laddat avsked via Twitter.
I fredags kväll meddelade Turkiets regering att ett 48 timmar långt utegångsförbud skulle införas i 31 av landets största städer. Problemet var att det skulle införas bara några timmar senare, vid midnatt, och människor i hela landet fick bråttom att ge sig ut och sista minuten-handla.
Inte informerats
Framför allt i Istanbul, Turkiets största stad och ekonomiska nav, översköljdes centralt belägna butiker och kiosker av människor som behövde köpa på sig livsmedel innan de skulle bli tvungna att stanna hemma över helgen.
Beslutet kritiserades också av Istanbuls borgmästare Ekrem Imamoglu, från oppositionella Republikanska folkpartiet (CHP), som sade sig inte ha fått någon information innan stadens 15 miljoner invånare beordrades att stanna hemma.
Men bara någon timme efter att Süleyman Soylus avgångsbesked blev känt kom ett motsatt besked från president Recep Tayyip Erdogans kansli.
"Vår inrikesministers avgång har inte accepterats av presidenten", hette det i uttalandet.
Över 1 100 avlidna
För två veckor sedan petade president Erdogan transportminister Mehmet Cahit Turhan, sedan hans departement kritiserats för att ha hållit en upphandling om ett stort kanalprojekt mitt i virusuppståndelsen.
Om Süleyman Soylu trots allt avgår blir han därmed den andra ministern som lämnar Turkiets regering under coronakrisen.
Fler än 1 100 människor har avlidit i covid-19 i Turkiet hittills. Smittan upptäcktes för första gången i landet den 11 mars.