I ett uttalande säger Twitter att deras regler inte tillåter meddelanden som kan utsätta människor för att smittas av coronaviruset.
I klippen går Bolsonaro på gatorna i huvudstaden Brasilia och pratar med "vanligt folk" och uppmanar dem att gå till jobbet och fortsätta få de ekonomiska hjulen att snurra.
– Om det fortsätter så här kommer arbetslösheten som följer bli ett mycket stort problem som det kommer att ta år att lösa, säger han bland annat.
Senare på söndagen fortsatte Bolsonaro på samma spår under en presskonferens.
– Brasilien kan inte stanna, då blir vi som Venezuela, sade Bolsonaro till journalisterna.
– Låt oss ta oss an det här viruset realistiskt. Det här är livet, vi kommer alla en dag att dö.
Tidigare har presidenten bland annat ifrågasatt den egna regeringens statistik över coronarelaterade dödsfall, som han menar överdrivits för att tjäna "politiska intressen", och i fredags lanserade han en tv-sänd reklamkampanj som uppmanar människor att fortsätta gå till jobbet som vanligt.
Minst 114 personer har avlidit i covid-19 i Brasilien, som har 3 900 konstaterade fall.