Haavisto höll på måndagen en pressträff, dagen efter det att den turkiske presidenten Erdogan gjort ett utspel om att Turkiet kan komma att säga ja till enbart Finlands Natomedlemskap.
– Vårt starka önskemål är fortfarande att framskrida tillsammans med Sverige i vår Natoprocess, säger Haavisto.
– Sverige är Finlands närmaste granne i säkerhetspolitiken. Finlands linje har inte ändrats.
Turkiets president Recep Tayyip Erdogan upprepade i ett tal i söndags att Turkiet kan komma att godkänna Finlands Natoansökan även om Sverige får nej.
Enligt Haavisto tyder det på att Finland har gjort framsteg i Natoprocessen, när det gäller att uppfylla det samförståndsavtal som finns mellan Turkiet, Sverige och Finland.
Han förklarar att "det har varit tydligt" att Turkiet har fler olösta frågor med Sverige än Finland.
Haavisto uppger att han talat med sin turkiske kollega efter Erdogans utspel, men även med Sveriges utrikesminister Tobias Billström (M) och med Nato.
Samtalet med Billström handlade mest om att informera Sverige om de kontakter Finland haft med Turkiet.
Haavisto hoppas fortfarande på att de två nordiska länderna kan bli Natomedlemmar till Natotoppmötet i Vilnius i juli.
– Jag ser fram emot Vilnius som ett viktigt skede då jag hoppas att båda länderna ska accepteras som Natomedlemmar, säger han.