Enligt polisens uppgifter hade skoterföraren kört ut för ett stup.
Larmet om olyckan kom på lördagseftermiddagen.
Den skadade mannen fördes med ambulanshelikopter till sjukhus i Tromsö i Norge. På kvällen meddelade sjukhuset att han är allvarligt skadad, men att tillståndet är stabilt.
Efter olyckslarmet inleddes en räddningsinsats och fjällräddare skickades till platsen. Det är fortfarande oklart hur olyckan gick till. Polisflyget ska dokumentera olycksplatsen.