Olyckan inträffade under lördagen då en personbil kolliderade med skotern, när skotern skulle korsa E12 norr om Tärnaby.
Mannen fördes till sjukhus med ambulanshelikopter, men under söndagen rapporterade Region Västerbotten att mannen avlidit till följd av sina skador.
Händelsen inträffade vid klockan 16.30 på påskaftonen. Händelsen utreds som vårdslöshet i trafik.