Carlson har tidigare fått förlängt till den 31 oktober, men nu förlängs förordnandet ytterligare till den 28 februari 2022.
Johan Carlson tillträdde som generaldirektör 2014 när Smittskyddsinstitutet, Statens folkhälsoinstitut och delar av Socialstyrelsen slogs samman till det som i dag är Folkhälsomyndigheten.
Det pågår en rekryteringsprocess för att tillsätta en ny generaldirektör, men på grund av sommarens regeringskris fick den processen tillfälligt pausas och bedöms därför inte vara helt klar innan den 31 oktober.