Priset delas ut årligen sedan år 2000 av en organisation där bland andra Göteborgs stad, Västra Götalandsregionen, Chalmers, Göteborgs universitet och en rad företag ingår.
Temat för årets pris är desinformation. Bellingcat hyllas som förebilder i kampen mot denna, inte minst för sitt sätt att använda och sammanställa öppna källor i underrättelsesyfte.
"Genom att även tillgängliggöra sina verktyg och metoder bidrar de till att öka vår gemensamma förmåga att hantera och stå emot antidemokratiska krafter", säger juryordförande Annie Hohlfält i pressmeddelandet.
Bellingcats avslöjanden har bland annat gett bakgrund till en uppmärksammad dokumentär om mordförsöket på den ryske oppositionspolitikern Aleksej Navalnyj.
Britten Eliot Higgins, som grundade Bellingcat, får ta emot priset vid en ceremoni i oktober.
Priset, som på engelska kallas Win Win Gothenburg Sustainability Award, har olika teman för varje år.
Bland tidigare pristagare märks Margot Wallström, USA:s tidigare vicepresident Al Gore och FN:s tidigare generalsekreterare Kofi Annan, men även elhybridbilen Toyota Prius.