Det var ett elfel som från 15-tiden på onsdagen orsakade problemet, som påverkade sträckan som mellan Stockholm i norr och Malmö i söder har 17 stationer.
Strax efter klockan 19 på kvällen kunde tågen börja rulla igen efter att elen kommit tillbaka, uppger SJ.
– De rullar, men det är naturligtvis förseningar, säger Leila Fogelholm, kommunikatör vid SJ, till TT.
– Vissa stod ju still i några timmar, så de kommer att komma fram några timmar sent, fortsätter hon.
Östgötatrafikens trafikledning utesluter inte att felet orsakades av de högra temperaturerna i området.
– Det kan finnas en förklaring där. Vi hoppas finna svar på den frågan i det fortsatta arbetet, säger Isak Leek, trafikledare vid Östgötatrafiken, till Östgöta Correspondenten.