Han dog när han tillsammans med sina styrkor gick till attack mot angriparna. Minst 19 personer dog i våldsamheterna.
Befälhavaren Hamdullah Mokhlis var medlem i det hårdföra Haqqani-nätverket, som kopplats till några av de mest våldsamma attackerna i Afghanistan de senaste åren och som blivit stämplade som en terrororganisation av USA. Han är den högsta person inom talibanerna som dödats sedan extremiströrelsen tog över makten i landet i augusti.
IS har tagit på sig dådet mot militärsjukhuset.
Talibanerna har lovat att stabilisera läget i det krigshärjade Afghanistan. Hittills har styret, som inte erkänts av något land, haft svårt att leva upp till löftet och bland annat har IS genomfört flera dödliga attacker.