Minst sju personer dödades och 41 skadades i explosionen. Bland offren finns flera barn, enligt en representant för de styrande talibanerna.
Ingen har sagt sig stå bakom attentatet, som skedde i stadens diplomatkvarter.
Bomben detonerade i samband med att människor lämnade moskén efter fredagsbönen, enligt polisens talesperson Khalid Zadran.
– Att attackera moskéer och besökare där är ett oförlåtligt brott, säger han.
Attacken är den senaste i raden sedan talibanerna tog makten förra året. Terrorgruppen IS har tagit på sig flera av de tidigare dåden, ofta riktade mot shiamuslimer.
FN:s besittning i Kabul skriver på Twitter att händelsen är ännu en "bitter påminnelse" om det ansträngda läget när det gäller säkerhet och terrorism i landet.