Inledningsvis är det inte fastställt vad som orsakat händelsen.
En talesperson för polisen bekräftar att det finns offer men ger inga detaljer om händelsen.
Ett av vittnena uppger att flera personer dödats och skadats i explosionen, som ska ha inträffat under fredagsbönen.
– Efter explosionen fördes ett stort antal martyrer och skadade människor till sjukhus. Situationen är inte alls bra, säger Abdul Hamid i staden Pol-e Khomri i provinsen Baghlan till AFP.