På bilder syns bönemattor täckta i blod. Explosionen, enligt talibanerna ett självmordsdåd, ägde rum mitt under fredagsbönen, då flest människor vanligtvis befinner sig i moskén.
"Till följd av detta har flera landsmän blivit martyrer eller skadats", bekräftar talibanernas talesperson Zabihullah Mujahid på Twitter.
Enligt Dost Mohammad Obaida, en talesperson för talibanpolisen, har minst 100 personer skadats eller dött.
– De flesta av dem har dödats, säger han.
Ingen har ännu tagit på sig dådet.
Flera attacker i Afghanistan den senaste tiden, däribland ett dåd vid en moské i Kabul, har tillskrivits terrorgruppen IS afghanska gren, IS Khorasan.
Terrorgruppen har tidigare riktat in sig på att attackera minoritetsgrupper som shiamuslimer, som utgör cirka 20 procent av Afghanistans befolkning.
Många av landets shiamuslimer tillhör folkslaget hazarer, som blivit förföljda av extremistgrupper i årtionden.