Det tre dagar långa mötet inleddes under torsdagen, med tusentals män som representerar Afghanistans många olika distrikt och byar närvarande.
Det är talibanerna som kallat till mötet, som traditionellt hålls av Afghanistans ledare, för att fundamentaliströrelsens hårdföra politik ska diskuteras och få stöd ute i landet.
Beskjutningen kom enligt talibanerna från två personer vid ett närliggande tak när mötet skulle inledas. Det finns inga uppgifter om att någon annan än gärningspersonerna kommit till skada.
Inför mötet sade en källa inom talibanerna att frågor om utbildning för flickor troligtvis kommer att tas upp.
Sedan talibanerna tog makten över Afghanistan har äldre flickor inte tillåtits gå i skolan, och kvinnor har fått flera rättigheter fråntagna dem.
Inga journalister får närvara på mötet. Inga kvinnor kommer heller finnas på plats när frågor som rör deras framtid diskuteras.
Det är inget problem, säger talibanernas biträdande premiärminister Mawlawi Abdul Salam Hanafi till statliga tv-kanalen RTA, eftersom kvinnorna ändå kommer att representeras av sina manliga släktingar.