Dessa regler framgår av ett dekret i form av ett mångsidigt dokument som utfärdades i lördags av "utbildningsansvariga" inom talibanstyret, rapporterar nyhetsbyrån AFP.
Dokumentet har tagits fram inför öppnandet av privata universitet och högskolor på måndagen. Efter 2001 då dåvarande talibanregimen tvingades från makten i Afghanistan har privata utbildningsinrättningar vuxit stort i landet.
Stoppa umgänge och mingel
Det nya dekretet påbjuder att kvinnor och män måste hållas åtskilda på universiteten. Om detta är praktiskt svårt att genomföra kan draperier sättas upp i lokalerna för att hålla isär könen.
Under det förra talibanstyret mellan 1996 och 2001 var kvinnor i praktiken utestängda från universitets- och högskolevärlden.
I dokumentet finns ingen regel om att kvinnor måste bära heltäckande burka, men den ogenomskinliga slöjan niqaben som påbjuds täcker hela kroppen förutom ögonen.
På senare år har antalet kvinnor som bär de heltäckande, oftast ljusblå, burkorna samt niqaberna minskat i de större städerna, men på den afghanska landsbygden är de fortfarande vanligt förekommande.
Även om kvinnor nu, enligt det nya dekretet, tillåts studera så måste deras lektioner avslutas fem minuter innan männens tar slut. Medan de manliga studenterna lämnar utbildningsbyggnaden ska kvinnorna stanna i "väntrum", skriver AFP. Syftet är att stoppa umgänge och mingel mellan kvinnor och män utanför byggnaden när studiedagen är över.
– Praktiskt är det en svårgenomförbar plan, vi har inte tillräckligt många kvinnliga lärare för att kunna separera flickorna, säger en universitetslärare som inte vill uppge sitt namn.
– Men det faktum att de tillåter flickor att gå i skola och läsa vid universitet är ett stort steg framåt, tillägger han.
Dödliga attacker
Jämfört med den förra talibanregimen har talibanerna som tagit över nu slagit an en något mjukare ton. Vid en presskonferens kort efter maktövertagandet i augusti sade talespersonen Zabihullah Mujahid att kvinnor utgör en "viktig del" av samhället.
Före talibanernas återkomst har kvinnor kunnat studera sida vid sida med män. Samtidigt har brutala och dödliga attacker på senare år riktats mot skolor och lärosäten med flickor och kvinnor.
Talibanrörelsen har dock nekat till att man ligger bakom dessa attacker. I stället är det terrorgruppen IS – som ser ut att vinna allt mer mark i Afghanistan – som hävdar att man genomfört de dödliga dåden mot flickor och kvinnor.