Den 34-årige man från Australien som misstänks ligga bakom driften av marknadsplatsen greps nära den tysk-danska gränsen. Samtidigt beslagtogs över 20 servrar i Moldavien.
"Utredare lyckades stänga ner marknadsplatsen och stänga av servrarna i måndags", säger åklagaren enligt ett pressmeddelande.
Det som åklagaren kallar "världens största handelsplats på darknet" hade vid nedstängningen nästan en halv miljon användare och fler än 2 400 säljare världen över. Minst 320 000 transaktioner hade genomförts till ett värde av 140 miljoner euro.
På marknadsplatsen såldes "alla sorters droger", förfalskade pengar, stulna och förfalskade kreditkort, anonyma sim-kort, skadlig kod och mycket mer.
"Utredarna räknar med att kunna använda den data som sparades för att starta nya undersökningar mot marknadsplatsens moderatorer, köpare och säljare", säger åklagaren.
Amerikansk, australisk, brittisk, dansk, schweizisk, ukrainsk och moldavisk polis deltog i insatsen som samordnades av Interpol.